Уменьшение уставного капитала ООО

Уменьшение (тем более по требованию закона) уставного капитала - процедура, которая вообще не подпадает под понятие сделки. Здесь нет ни договаривающихся сторон, ни выгодоприобретателя.
Соответственно, правила о порядке одобрения крупной сделки при принятии такого решения не применяются.
НО
Вопрос об участии общества в другом хозяйствующем субъекте (как раз ваш случай - когда ЗАО учредитель ООО) относится к компетенции совета директоров ЗАО (либо собрания учредителей, если совет директоров ЗАО по уставу не формируется)
Соответственно именно этот орган управления ЗАО должен принять решение об уменьшении размера уставного капитала ООО (если, конечно, этот ЗАО единственный учредитель ООО).
И уже на основании этого решения генеральный директор ЗАО - как лицо, представляющее интересы ЗАО в ООО, подпишет соответствующее решение ООО об уменьшении его уставного капитала.

решение принимают участники общества, возможно что по инициативе директора. кстати, если в ООО, ЗАО пусть даже мелком не работает юрист, светлое будущее его точно не ждёт!!

Уменьшение уставного капитала не является крупной сделкой (т.к.не происходит отчуждения, приобретения имущества). Следовательно, не потребуется и одобрения крупной сделки, достаточно принятия решения об уменьшении уставного капитала. "от ЗАО "А" ген директор подписывает протокол" - не поняла какой именно протокол имеется в виду, то ли протокол об уменьшении УК, то ли об одобрении крупной сделки, но в любом случае, подписывать любой протокол собрания участников "Б" будет ген.директор, так как ген.директор является законным представителем ЗАО "А".