Подскажите, может ли ИП быть владельцем продовольственного рынка?

Почему нет, если он оформит все на себя, а не на ООО.

конечно - землю в собственность и вперед хоть ядерный завод

Конечно может. Необходимо лишь оформить документы.

По ФЕДЕРАЛЬНому ЗАКОНу "О РОЗНИЧНЫХ РЫНКАХ..." от 30.12.2006 г. разрешение на право организации рынка выдаётся только юридическим лицам.

Он - что,этот ИП - идиот? Разницу между ИП и ООО - посмотрите...

И даже президентом страны.