Мой начальник предлагает мне написать заявление на увольнение,из за моих пропусков по делам военкомата. Что надо делать?

ничего не делать. заявление ни в коем случае не пишите !
у начальника есть претензии к вам - пусть выражает их письменно, в форме дисциплинарного взыскания типа Замечания (ст.192 ТК РФ) или Выговора (ст.192 ТК РФ).

будет взыскание - будем оспаривать в суде и наказывать начальника на деньги.
пишите, если что

т.е. как это по делам военкомата? ты если туда ходишь по собственной нужде - повестки бери и начальству показвый.и отпуск за свой счет проси чтоб дали. а то прогул влепят и уволят точно! а если по работе туда ходишь - маршрутный лист с собой бери.

Во-первых, при посещении военкомата у Вас должен быть на руках оправдательный документ, подтверждающий сей факт.
Имея такие документы, Вы можете смело посылать начальника ДАЛЕКО: оснований для увольнения за ПРОГУЛЫ у него НЕТ.

Дела военкомата прикрыты повестками? Если да, то не пишите.
А если нет, то можно и по статье за прогулы вылететь, и трудовую этой записью испортить.

Возьмите повестку из военкомата, если она на руках то уволить не имеют права.

Пусть наказывает согласно ТК... Попросите дать Вам ещё один шанс, иначе если Вы просто встанете в позу, то он найдёт ещё касяки и уволит по статье... Если на ковёр руководство не вызывали, штраф не платили, то шансы на прощения есть...

Если вы часто носите в военкомад что-то вместо сына и при этом не отпрашиваетесь у начальства - эт косяк. на роботе вам же не за отсутствие платят.