как быть? -один из родственников не даёт согласие на прописку а закон требует регистрации в 90 дневный срок..

Замочить такого родственника!

Можно подробнее - кто собственник квартиры, в долях или совместная какой родственник - дядя, тетя, бабушка, отец. А есть кто согласен на регистрацию?

Ничего тут не сделаешь.Действительно , для регистрации необходимо письменное согласие всех лиц,зарегистрированных в данной квартире.Посмотрите обьявления,там очень много предложений постоянной и временной регистрации.Обойдется вам это немного подороже,но на первое время можно воспользоваться таким вариантом.

Зарегистрироваться временно можно и на съемной квартире, вовсе не обязательно у родственников, они не обязаны, раз не согласны