Скажите каким образом может быть задействован банк в продаже квартиры через агенство недвижимости

Если квартира не под ипотекой, то банк может быть задействован в сделке только на основании договора. И штраф может быть выставлен только за нарушение договора, и только тех пунктов, за которые предусмотрены штрафные санкции текстом договора или действующим законодательством.
Так что внимательно читайте перед подписанием.

Как правило, это касается квартир, купленных в кредит, когда заемщики не в состоянии рассчитываться с банком. Штраф обычно выставляется не за "затягивание сделки", а именно за просрочку в платеже. При прдаже такой квартиры банк является полноправным участком сделки и вправе выставлять свои требования, особенно, если заемщик уже не в числе клиентов с положительной историей.

Банк - собственник всего/части жилого здания или он финансирует на свои средства ипотеку, т.е. расплачивается за Покупателя с собственником квартиры, а покупатель ему возращает с процентами равнозначными месячными платежами...

Ну а сделка купли-продажи - везде одинаковая, ее срыв/затягивание/отсрочка, грозит потерей финансов виновной стороне, в любом случае, согласно нормам действующего законодательства РФ...