Работаю не по трудовому договору у ИП, хочу пойти в декрет, на что он ответил, что платить не собираеться. Что делать?

Если совсем никак не оформлены, ничего не поделаешь.. Даже, если заключен гражданско-правовой договор, то пособие по беременности и родам не выплачивается (п. 5 Положения, утв. Постановлением Правительства РФ от 30 декабря 2006 г. N 865, п. 2 ст. 2 Федерального закона от 29 декабря 2006 г. N 255-ФЗ). Только если договор срочный, то работодатель обязан продлить его до наступления декрета...
Если на несколько месяцев устроиться официально, то он не сможнт вас уволить (хотя затрат ИП как таковой не понесет, оплата декрета будет из соцстраха однако геморой с отчетностью, проверками правильности начисления обязательно приобретет) Поэтому и не хочет брать официально, будь я его юристом, я бы не советовала тебя оформлять сейчас, к сожалению...

уходить, ведь он прав, а еще можешь куда нибудь пожаловаться что он уходит от уплаты налогов ведь ты неоформлена,и соответственно он не платит налоги по твоей зарплате и вообще зачем ты работаешь не оформленная???

интересно - на кокой системе налогооблажения ваш ИПшник состоит?
вообще то государство вам отстегнет пособие по уходу в дикрет (ФСС), но вопрос в размере. или вы уйдете в дикрет как не работающая или работающая. по последнему (работающая) вам придеться доказывать факт осуществления трудовых отношений (это суд). ИПэшника конечно оттянут за непроведенного аботника и ФСС и ПФ РФ. но вам от этого не легче будет (хотя моральное удовлетворение получите))).
собирайте доказательства своей тр.деятельности у него.
и сходите в местный фондсоциального страхования - там вас просветят и о размерах пособия и о сроках постановки на учет