После длительного отсутсвия коронки, челюсть с правой стороны стала щелкать

У Вас дисфункция височнониижнечелюстного сустава. Она развилась вследствии того, что жевательное давление распределяется неравномерно.
Причин несколько( результат травмы, отсутствие зубов, повышенная патологическая стираемость зубов, патология прикуса и т.д.). В вашем случае, видимо из-за отсутствия зубов ( одного или нескольких). К тому же, если зуб отсутствует длит. время, то соседние начинают перемещаться . Возникает деформация зубных рядов, челюсть при жевании начинает неправильно двигаться. Вот сустав и страдает.
Лечение тут одно-рациональное протезирование. К сожаление ничем другим это не исправить.

Думаю, что ваш стоматолог был прав - вам все-таки надо идти к хирургу. Сустав, как вы знаете, это соединение поверхностей двух костей. В норме, они располагаются на определённом расстоянии, а между ними находится синовиальная жидкость, которая не позволяет поверхностям костей тереться друг об друга и травмироваться. Все это дело покрыто суставной сумкой: мышцами и сухожилиями. Сустав начинает щелкать, если разболталась суставная сумка. Это вам грозит привычным вывихом в лучшем случае, то есть сустав будет не просто щелкать, а еще и вывихиваться постоянно. А еще может быть уменьшение синовиальной жидкости, а это влечет еще больше проблем. В общем, вам надо, пока не поздно, это дело исправлять. Так что идите к хирургу.