через 76 счет делаете проводки. не забудьте про акт и соглашение о взаимозачете
ведение БУ не зависит от организационно-правовой формы и формы собственности. Что с ИП вы делаете зачет, что с юл - одинаково в учете.
Делается акт взаимозачета (с любой стороны). В учете ЗАО будет делатся проводка на желаемую сумму взаимозачета: Дебет 60 Кредит 62. Таким образом перекрывается обязательство на определенную сумму для обеих сторон. У ИП это не отражается в проводках, поскольку он освобожден от ведения бухгалтерского учета.
Что с ИП вы делаете зачет, что с юл - одинаково в учете.