Надо ли уплачивать отчисления в пенсионный фонд при применении УСН, ведь УСН отменяет уплату ЕСН?

Надо в части страховой и накопительной части.

Организации, применяющие упрощенную систему налогообложения, производят уплату страховых взносов на обязательное пенсионное страхование в соответствии с законодательством Российской Федерации - абз.3 п. 2 ст. 346.11 НК РФ.

Вы немного путаете....отчисленя в ПФР (взносы) являются откладыванием денег на старость....и касаются каждого работающего....а ЕСН это налог в бюджет государтва и те кто на УСН от него действительно свобождены....

Нужно оплачивать взносы на ОПС, по причине что это разные налоги. И взносы на ОПС - это не ЕСН.