На что в Активе и Пассиве баланса особое внимание может обратить налоговая ?

на нераспределенную прибыль либо на убыток.
На увязку Прибыль - прибыль на начало отч. периода = прибыль в Ф2
на соотношение сумма кредиторской задолженности с остатком товара + сумма дебиторки
на ликвидность товара/продукции

в Ф2 - на соответствие графы "доходы" декларации по прибыли и декларации по НДС