Можно ли подать заявление в налоговую на налоговый вычет не в ту в которой выдавали инн а в другую?

Если вычет имущественный или социальный,то по месту прописки.Стандартные вычеты по месту работы.

Имущественный?
Получить имущественный налоговый вычет при покупке (строительстве) жилья можно у работодателя и в налоговой инспекции. Для этого покупателю жилья нужно обратиться в налоговую инспекцию по местожительству (п. 2 ст. 220 и п. 2 ст. 229 НК РФ).