Какие будут трудности если ехать на авто из Москвы в Новосибирск, особенно при пересечении границы с Казахстаном

Во первых у тебя будет четыре таможни на казахской придется заплатить за въезд, застроховать машину, заполниш там деклорацию, а лучше объехать казахстан через Екатеренбург, Омск, проблем меньше.

Однозначно - таможня!