Своё название Сперлонга получила от лат. Speluncae – впадина, благодаря многочисленным естественным углублениям. После падения Римской империи, была заселена местными народностями. Чтобы защитить себя от постоянных набегов пиратов, были воздвигнуты смотровые башни. Башня Трулья была построена на самом окончании мыса в 1532, но два года спустя была разрушена набегом пирата Каир-эт-Дин, более известным как Красная Борода. Он разорил дотла город, убив и пленив всё население, и попытался похитить красавицу-графиню Джулию Гонзака, чтобы подарить её султану Сулейману. Об этих событиях осталась память в названии «Долина Корсаров» у Грота.

Настоящее развитие города началось с постройкой в 1957 году дороги, соединяющей Террачину с Гаэтой. Международную известность Сперлонга получила благодаря актёру Рафу Валлоне, который влюбился в этот город во время съёмок одного из своих фильмов. В течение 30 лет актер приглашал в Сперлонгу своих друзей, в числе которых были Марлен Дитрих, Бриджит Бардо, Артур Миллер.