Считается ли сделка по продаже акций предприятия у которого отчет о выпуске ценных бумаг не прошел госрегистрации

Нет, не считается. Это просто бумажки пока, а ценными станут после регистрации.

если госрегистрация обязательна, то договор по продаже акций считается заключенным с момента гос. регистрации.

Сделка считается, но считайте что купили фантики, а не акции.

сделка о продаже ценных бумаг ?
нет регистрации, нет ценной бумаги