12. При осуществлении с 1 января 2009 года товарообменных операций, зачетов взаимных требований, при использовании в расчетах ценных бумаг суммы налога, предъявленные налогоплательщику при приобретении им товаров (работ, услуг), имущественных прав, принятых к учету до 31 декабря 2008 года включительно, подлежат вычету в соответствии с главой 21 Налогового кодекса Российской Федерации в редакции, действовавшей на дату принятия к учету указанных товаров (работ, услуг), имущественных прав.

Сложности возникают, если зачет проведен в 2009 году, но один из контрагентов получил товар в 2008-м, а отгрузил своему поставщику — в 2009 году.

В этом случае перечислять НДС платежным поручением придется той стороне, которая приняла к учету товар в прошлом году. Сумму налога она отразит в строке 240 раздела 3 декларации за тот период, в котором НДС был уплачен. Сторона, получившая встречную поставку в 2009 году, формально перечислять налог не обязана. Однако очевидно, что взаимозачет в такой ситуации будет проведен на сумму без НДС. Поэтому разницу, не вошедшую в акт зачета, второй стороне все равно придется перечислить деньгами своему контрагенту.