Как центральный банк может защитить вклады граждан в коммерческих банках?

При их банкротстве он возместит тебе сумму вклада (обязательств) из своих средств. Но не всю. Максимально - до 700 тыр. И не сам. И настаивать не будет.

он (точнее гос-во) их страхует, если они больше 700 000, а там всякая мелочь никому не интересна

выплатит из своих денег вклады до 700 тыс руб

Ни как. Это Агентство по страхованию вкладов выплачивает компенсацию до 700 тыс.