Расскажите про ведение бухгалтерии при ИП упрощенка 6%. Как может начисляться зарплата надо ли уплачивать НДФЛ?

Если есть сотрудники, то зарплата начисляется как положено, удерживается НДФЛ и уплачивается ОПС. Если вас интересует снятие собственных средств, то вы после уплаты Единого налога вправе распоряжаться ими по собственному усмотрению - переводить на вкладной счет (основание - перечисление собственных средств либо доходов от предпринимательской деятельности, оставшихся после налогообложения - дюбая формулировка), снимать, расплачиваться за товары, работы или услуги. Такие перечисления дополнительно не облагаются НДФЛ.
Лень искать, но в НК в части НДФЛ есть пункт, гласящий, что доходы ИП не подлежат дополнительному обложению НДФЛ

А вот Вам ссылка на НК
http://base.consultant.ru/cons/cgi/online.cgi?req=doc;base=LAW;n=82988;div=LAW
Смотрите оглавление
Раздел VIII.1. Специальные налоговые режимы
Глава 26.2. Упрощенная система налогообложения