Предприниматель вносит свои личные средства,вкладываясь в дело.Как по бух.учету эту сумму провести в 1С.Мы на УСН доходы

Финансовое вложение от частного лица с оформлением договора. Посадите на 76 счет.

Как займ

Да все верно, оформите договор займа с учредителем, с участником бизнеса, через 66 (если договор краткосроный) или через 67 (если долгосрочный). Потом вернете через банк, когда появится прибыль.

Заем предпочтительнее, так как в доходы он не идет.

Ко всему вышенаписанному.Вклад учредителя тоже не включается в доход.

ну да или заем, или увеличение уставного капитала за счет собственных средств