как разгарничить полномочия внутри ООО между учредителями, можно ли это сделать?может быть у ООО две одинаковых печати?

это должно быть прописано в уставе ооо. почитайте ваш устав, а если вы только собираетесь открыть общество то предусмотрите это в уставе. либо созывается общее собрание учредителей на котором обсуждаются данные вопросы и принимаются соответствующие решения, все это должно быть отражено в протоколе. по второму вопросу: да, конечно у ооо может быть две одинаковые печати.

Обычно есть понятие "общее собрание учредителей" и "единоличный орган" - то есть или все вместе решают, или решение принимает назначенный орган (например, директор). В основном, полномочия учредителей, если они не являются каким-либо органом или должн. лицом в юр. лице (фин. директором, директором, главбухом) сводятся только к назначению последних, снятию, принятию решения о ликвидации, реорганизации и т. д.
Все можно прописать в уставе + роль играет распределение долей в уставном капитале - 50+50 или 70+30 - разные вещи

Между учредителями разграничить полномочия нельзя, так как это равные субъекты, которые принимают решения по ООО в виде общего собрания учредителей. Общее собрание учредителей является высшим органом управления в ООО. Круг вопросов, отнесённых к исключительной компетенции учредителей перечислен в ФЗ "Об обществах с ограниченной ответственностью" и в Уставе ООО. Решения на общем собрании принимаются путём голосования. Каждый учредитель имеет столько голосов, на сколько его вклад в уставный капитал ООО.
Относительно печати, в законе указано что общество должно иметь свою печать (не печати). Вы скорее всего опасаетесь того, что в результате возникшей ссоры один учредитель может наделать сделок втайне от другого?